当年三月初一，杜松部抵达萨尔浒一线，此时，杜松部对外号称6万人，实际兵力约为3万，但其中2万余人是羸弱不堪的正军，只有不足一万人是杜松名下的家丁。
因此杜松便命令监军张铨督促部将王宣、赵梦麟等统帅这2万正军在萨尔浒筑营，自己带着全部家丁去进攻苏子河对岸，吉林峰脚下、后金军正在扩建的界凡城。
殊不知，这个时候努尔哈赤已经率领大军潜伏到了他的身后，就等着杜松露出破绽后，加以致命一击了----当时阿巴海提议，全军攻打萨尔浒，优先截断杜松的退路，但技高一筹的努尔哈赤却下令代善、阿巴海率各自名下旗兵进攻界凡城下杜松部，自己率主力6旗兵同时猛攻萨尔浒，让杜松首尾难顾。
战斗的结果跟努尔哈赤预想的一样，受到后金主力4.5万人进攻的2万明军根本挡不住敌人的猛攻，除一部战死外，其余不得不逃过萨尔浒河，并在萨尔浒河西岸的得力阿哈地区遭到了毁灭性的打击，最终全军覆没。
消灭了萨尔浒的明军之后，努尔哈赤立刻调动预备部队增援代善的正红旗和阿巴海的正白旗，由此，杜松便彻底陷入了重围之中。
杜松部困兽犹斗，拼命发炮杀敌，但此时天空被硝烟遮蔽，明军开炮时的亮光反而暴露了自身，后金军便潜近后发射重箭----女真重箭的箭头跟红缨枪的枪头相仿，可谓中者立毙----杜松也因此面部中箭而死。
杜松死后，其家丁虽然奋战到底，但最终挽回不了灭亡的命运。
消灭了杜松部，努尔哈赤得知马林部已经出了三岔口，赶到了浑河以北地区，但马林在得知杜松部覆灭后不敢继续前进，便以主力2万人在尚间崖一线筑营坚守，并以部将潘宗颜部守斐芬山、部将龚念遂守斡辉鄂模，如此互为犄角。
“好，好极了！”努尔哈赤大喜道。“北路明军兵力本就不足，如今又兵分三路，当各个击破。”
努尔哈赤因此命令集中力量首先进攻斡辉鄂模。
面对后金军数万大军的进攻，只有不足5000人，其中家丁不过500人的龚念遂部根本无力抵抗，很快就被消灭殆尽；后金军越打气势越是如虹，以胜者勇的状态继续进攻尚间崖马林部主力营房。
马林是名将马芳的儿子，可谓家学渊源，但此时马林犯了一个极大的错误，他见前来牵制自己的后金军只有四五千人，便认为后金军在与杜松部交战后，伤亡惨重，就只剩下这些部队了，于是便率领主力出营实施反攻击。
然而就在马林部对前期抵达的后金军实施反攻的时候，消灭了龚念遂的后金军主力赶到，对马林部实施了前后夹击，马林因此大败，随后守备斐芬山的潘宗颜部也被击破，包括副将麻岩在内的一众明军官兵死伤惨重，只有马林带着极少部分部下逃出生天。
消灭了马林部后，努尔哈赤立刻命令扈尔汉、阿敏、代善、阿巴海等人率着已经打得亢奋的后金南下消灭刘铤所部明、鲜联军。
虽然马林在得知杜松部覆灭后已经紧急向杨镐做出了报告，但杨镐派出的传达撤退命令的信使只找到了进军迟缓的李如柏部，而负责通知刘铤的信使却落入了后金军的手中，使得刘铤完全不知道战局已经出现了重大变化，失去了及时撤退的机会。
当年三月初四，刘铤部在阿布达里岗一线遭到后金军的伏击，刘铤战死，协同刘部作战的朝鲜军队却在将领姜弘立等人的率领下主动向后金方面投降了。
至此，除了接到杨镐命令的李如柏部得以大部安全退回外，其余三路明军纷纷覆灭，前后大约有4.5万名明军士兵及上百名明军将领战死，至此，萨尔浒之战以明军失败而告终，辽事自此不堪收拾了······